MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. T000240

Total Repeats: 91814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016860	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982543
2	NC_016860	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	378982543
3	NC_016860	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982543
4	NC_016860	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	378982543
5	NC_016860	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982543
6	NC_016860	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	378982543
7	NC_016860	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	378982543
8	NC_016860	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982543
9	NC_016860	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982543
10	NC_016860	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	378982543
11	NC_016860	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	378982543
12	NC_016860	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982543
13	NC_016860	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982543
14	NC_016860	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982543
15	NC_016860	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982543
16	NC_016860	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982543
17	NC_016860	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982543
18	NC_016860	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982543
19	NC_016860	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	378982543
20	NC_016860	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982543
21	NC_016860	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982543
22	NC_016860	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982543
23	NC_016860	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982543
24	NC_016860	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982543
25	NC_016860	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982543
26	NC_016860	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378982543
27	NC_016860	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	378982543
28	NC_016860	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	378982543
29	NC_016860	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982543
30	NC_016860	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982543
31	NC_016860	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982543
32	NC_016860	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982543
33	NC_016860	AATATC	2	12	1606	1617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378982543
34	NC_016860	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982543
35	NC_016860	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378982543
36	NC_016860	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982543
37	NC_016860	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982543
38	NC_016860	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982543
39	NC_016860	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982543
40	NC_016860	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982543
41	NC_016860	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982543
42	NC_016860	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982543
43	NC_016860	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982543
44	NC_016860	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982543
45	NC_016860	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982543
46	NC_016860	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982543
47	NC_016860	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982543
48	NC_016860	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	378982543
49	NC_016860	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	378982543
50	NC_016860	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	378982543
51	NC_016860	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	378982543
52	NC_016860	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982543
53	NC_016860	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982543
54	NC_016860	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982543
55	NC_016860	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	378982543
56	NC_016860	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982543
57	NC_016860	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982543
58	NC_016860	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982543
59	NC_016860	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982543
60	NC_016860	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982544
61	NC_016860	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982544
62	NC_016860	A	7	7	3060	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	378982544
63	NC_016860	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982544
64	NC_016860	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982544
65	NC_016860	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	378982544
66	NC_016860	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982544
67	NC_016860	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982544
68	NC_016860	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982544
69	NC_016860	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982544
70	NC_016860	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982544
71	NC_016860	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982544
72	NC_016860	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	378982544
73	NC_016860	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982544
74	NC_016860	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982544
75	NC_016860	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	378982544
76	NC_016860	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	378982544
77	NC_016860	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982544
78	NC_016860	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982544
79	NC_016860	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982545
80	NC_016860	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	378982545
81	NC_016860	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982545
82	NC_016860	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982545
83	NC_016860	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	378982545
84	NC_016860	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982545
85	NC_016860	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982545
86	NC_016860	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	378982545
87	NC_016860	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982545
88	NC_016860	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	378982545
89	NC_016860	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982545
90	NC_016860	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982545
91	NC_016860	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378982545
92	NC_016860	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982545
93	NC_016860	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982545
94	NC_016860	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982545
95	NC_016860	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982545
96	NC_016860	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	378982545
97	NC_016860	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	378982545
98	NC_016860	CG	3	6	4662	4667	0 %	0 %	50 %	50 %	378982545
99	NC_016860	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378982545
100	NC_016860	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982545
101	NC_016860	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	378982545
102	NC_016860	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982545
103	NC_016860	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982545
104	NC_016860	CAG	2	6	4742	4747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378982545
105	NC_016860	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982545
106	NC_016860	AG	3	6	4882	4887	50 %	0 %	50 %	0 %	378982545
107	NC_016860	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982545
108	NC_016860	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982545
109	NC_016860	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	378982545
110	NC_016860	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982545
111	NC_016860	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378982545
112	NC_016860	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	378982546
113	NC_016860	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982546
114	NC_016860	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378982546
115	NC_016860	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982546
116	NC_016860	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	378982546
117	NC_016860	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	378982546
118	NC_016860	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982546
119	NC_016860	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982546
120	NC_016860	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982546
121	NC_016860	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982546
122	NC_016860	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	378982546
123	NC_016860	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	378982546
124	NC_016860	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378982546
125	NC_016860	CAAAAT	2	12	5578	5589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378982546
126	NC_016860	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982546
127	NC_016860	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982546
128	NC_016860	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378982546
129	NC_016860	AATCAG	2	12	5873	5884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378982546
130	NC_016860	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	378982547
131	NC_016860	GCC	2	6	5979	5984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378982547
132	NC_016860	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378982547
133	NC_016860	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378982547
134	NC_016860	A	6	6	6266	6271	100 %	0 %	0 %	0 %	378982547
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264	NC_016860	A	6	6	13501	13506	100 %	0 %	0 %	0 %	378982553
265	NC_016860	TAC	2	6	13610	13615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378982554
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271	NC_016860	GGC	2	6	13859	13864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982554
272	NC_016860	GGC	2	6	13910	13915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378982554
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285	NC_016860	CGGT	2	8	14592	14599	0 %	25 %	50 %	25 %	378982554
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293	NC_016860	TTA	2	6	15163	15168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982555
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299	NC_016860	TTA	2	6	15317	15322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378982555
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388	NC_016860	CTT	2	6	20313	20318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378982560
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390	NC_016860	CGTCAT	2	12	20404	20415	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378982560
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